Traductor de ADN y ARNm a proteína
Pega una secuencia de ADN o ARNm y tradúcela codón a codón con el código genético estándar. Elige uno de los tres marcos directos o de los tres inversos, o mira los seis a la vez; los codones de parada aparecen como *.
Funciona en tu navegador: nada de lo que escribes se envía a ningún sitio.
Cómo se usa
- Pega una secuencia de ADN o ARNm (se saltan las cabeceras FASTA, los espacios y los números).
- Elige el marco de lectura. El +1 empieza en la primera base; elige Los seis marcos para compararlos.
- Elige códigos de una o tres letras y copia la proteína.
Cómo funciona
La secuencia se corta en codones de tres bases desde el inicio del marco elegido y cada codón se busca en el código genético estándar: ATG → M (Met), GCC → A (Ala), TAA → * (parada), etc. La traducción no se detiene en un codón de parada: se muestra el marco completo para que veas dónde están las paradas. Las una o dos bases sobrantes del final no se traducen. En los marcos inversos se traduce el reverso complementario.
Ejemplo
La secuencia de ejemplo ATG GCC ATT GTA ATG GGC CGC TGA AAG GGT GCC CGA TAG da en el marco +1
MAIVMGRKGAR
— 13 codones: Met-Ala-Ile-Val-Met-Gly-Arg, una parada (TGA), luego Lys-Gly-Ala-Arg y una parada final (TAG).
Consejos
- Para encontrar un gen, busca el marco con un ATG seguido de un tramo largo sin *.
- En el modo de seis marcos, cada marco es un registro FASTA (>+1 … >-3), fácil de pegar en otras herramientas.
- La traducción empieza justo en el marco elegido, no en el primer ATG; recorta la secuencia si quieres empezar en un codón concreto.
Preguntas frecuentes
¿Qué es un marco de lectura?
Los codones se leen de tres en tres bases, así que cada hebra puede cortarse en codones de tres maneras. El marco +1 empieza en la primera base, el +2 en la segunda y el +3 en la tercera; los marcos −1 a −3 hacen lo mismo en el reverso complementario. Normalmente solo un marco da una proteína larga sin codones de parada: el marco abierto de lectura.
¿Qué código genético se usa?
El estándar (tabla 1 del NCBI), el de los genes nucleares de la mayoría de los organismos. Las mitocondrias y algunos microbios usan variantes en las que, por ejemplo, TGA codifica triptófano en lugar de parada; esta herramienta no las aplica.
¿Qué significan * y X en la proteína?
* es un codón de parada (TAA, TAG o TGA). X es un codón con una base ambigua, como N, que no se puede traducir con certeza. En el modo de tres letras son Ter y Xaa.
¿Tengo que pasar el ARNm a ADN antes?
No. La U se lee como T, así que AUG y ATG dan metionina. Se ignoran espacios, saltos de línea, dígitos y cabeceras FASTA.