Cómo se usa
- Pega una secuencia: valen letras sueltas, líneas numeradas de GenBank o FASTA con cabeceras >.
- Elige Reverso complementario (por defecto), Complementario (mismo orden, bases pareja) o Reverso (mismas bases, al revés).
- Elige si el resultado se escribe como ADN (T) o ARN (U) y cópialo.
Cómo funciona
Cada base se sustituye por su pareja de Watson y Crick —A↔T (o U), G↔C— y los códigos IUPAC por el código del conjunto complementario. En el reverso complementario además se invierte el orden, para que la nueva hebra se lea de 5′ a 3′. Las mayúsculas y minúsculas se conservan letra a letra, así que las regiones enmascaradas en minúscula siguen viéndose. Cualquier carácter que no sea un código de nucleótido detiene la conversión con un mensaje que lo indica.
Ejemplo
La secuencia de ejemplo ATGGCCATTGTAATGGGCCGCTGAAAGGGTGCCCGATAG (39 bases) da el reverso complementario
CTATCGGGCACCCTTTCAGCGGCCCATTACAATGGCCAT
Se lee desde el final: la última base G pasa a C, luego A→T, T→A… hasta la primera base A, que queda como T al final.
Consejos
- Para diseñar un cebador reverso, toma el reverso complementario de la región del extremo 3′ del amplicón.
- El complementario sin invertir se lee 3′ → 5′; cuando un protocolo habla de «la otra hebra» suele referirse al reverso complementario.
- Las erratas, como una O en lugar de un 0 o una letra suelta, se señalan en lugar de borrarse en silencio, para que la longitud no cambie sin avisar.