График Лайнуивера — Берка
Вставьте концентрации субстрата и начальные скорости. Калькулятор переведёт их в 1/[S] и 1/v, проведёт прямую, нарисует график и найдёт Vmax по отрезку на оси y, а Km — по наклону или по отрезку на оси x.
Работает в браузере: всё, что вы вводите, никуда не отправляется.
Как пользоваться
- Введите концентрации субстрата и начальные скорости в том же порядке; все больше нуля.
- Смотрите график, наклон, отрезки на осях и найденные по ним Vmax и Km.
- При необходимости скопируйте точки, чтобы построить график в своей программе.
Формулы
Если взять обратные величины в v = Vmax[S] ÷ (Km + [S]), получится прямая:
1/v = (Km ÷ Vmax) × 1/[S] + 1/Vmax
Калькулятор проводит её обычным методом наименьших квадратов через точки (1/[S]; 1/v), затем:
- Vmax = 1 ÷ отрезок на оси y;
- Km = наклон × Vmax;
- прямая пересекает ось x в точке −1/Km.
Пример
Данные по умолчанию: [S] = 0,5; 1; 2; 4; 8; 16 и v = 2,1; 3,4; 5,0; 6,6; 8,0; 8,9. Точки идут от (2; 0,4762) до (0,0625; 0,1124).
- наклон 0,1874, отрезок на оси y 0,1035, R² = 0,9996;
- Vmax = 1 ÷ 0,1035 = 9,659;
- Km = 0,1874 × 9,659 = 1,8104, пересечение с осью x −1 ÷ 1,8104 = −0,5524.
Когда его использовать
- Чтобы наглядно показать данные и тип ингибирования — этот график приводят большинство учебников.
- Чтобы проверить нелинейную подгонку: точки должны лежать близко к прямой.
- Не как единственную оценку Vmax и Km, если скорости при низких концентрациях шумные.
Частые вопросы
Что такое график Лайнуивера — Берка?
Линейная форма уравнения Михаэлиса — Ментен: 1/v = (Km ÷ Vmax) × (1/[S]) + 1/Vmax. Если отложить 1/v против 1/[S], получится прямая: отрезок на оси y равен 1/Vmax, наклон — Km/Vmax, а ось x она пересекает в точке −1/Km.
Как по нему определить тип ингибирования?
Постройте данные без ингибитора и с ним. Прямые сходятся на оси y (Vmax та же, Km больше) — конкурентное ингибирование; на оси x (Km та же, Vmax меньше) — неконкурентное; прямые параллельны — бесконкурентное. Посчитайте каждый набор данных отдельно и сравните отрезки на осях.
Почему Vmax и Km не совпадают с прямой подгонкой?
Обратные величины растягивают шкалу: самые низкие концентрации становятся самыми большими x, а их малые скорости с наибольшей относительной ошибкой тянут прямую. Для данных по умолчанию прямая даёт Km 1,8104 и Vmax 9,659, нелинейная подгонка — Km 1,9544 и Vmax 9,9436. Для лучших оценок используйте калькулятор Михаэлиса — Ментен.
Можно ли ввести нулевую концентрацию?
Нет: у 1/0 нет значения. Не вводите контрольные точки и точки без измеримой скорости.