Calculadora del peso molecular de ADN y ARN
Pega una secuencia de ADN o ARN: los encabezados FASTA, los espacios y los números de línea se ignoran. Elige ADN monocatenario, ADN bicatenario (se añade la cadena complementaria) o ARN, y si el extremo 5′ lleva fosfato. Obtendrás el peso molecular, cuántos picomoles hay en un microgramo y el recuento de bases.
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Cómo se usa
- Pega la secuencia de 5′ a 3′. Sirven texto plano y FASTA.
- Elige la molécula: ADN monocatenario, ADN bicatenario o ARN.
- Elige el extremo 5′: hidroxilo para la mayoría de los oligos sintéticos, fosfato para productos enzimáticos u oligos fosforilados.
- Lee el peso molecular, la conversión entre masa y moles y el recuento de bases.
Fórmula
PM (ADNmc) = 313,21 × A + 304,2 × T + 289,18 × C + 329,21 × G − 61,96
PM (ARN) = 329,21 × A + 306,17 × U + 305,18 × C + 345,21 × G − 61,96
- 5′ fosfato: + 79,98 por cadena
- ADNbc: la suma de las dos cadenas
- 1 µg = 10⁶ ÷ PM pmol; 1 nmol = PM ÷ 1000 µg
Ejemplo resuelto
El oligo ATGC: 313,21 + 304,2 + 329,21 + 289,18 − 61,96 = 1173,84 g/mol. Como dúplex con su complementaria TACG (las mismas cuatro bases), 2 × 1173,84 = 2347,68 g/mol. El ARN AUGC pesa 329,21 + 306,17 + 345,21 + 305,18 − 61,96 = 1223,81 g/mol.
La secuencia por defecto de 66 bases tiene A 16, T 23, G 18 y C 9: 16 × 313,21 + 23 × 304,2 + 18 × 329,21 + 9 × 289,18 − 61,96 = 20.474,4 g/mol, así que 1 µg son 48,841 pmol.
Consejos
- Estimación rápida. Con estas masas de residuo, un nucleótido medio de ADN pesa unos 309 g/mol y un par de bases unos 618 g/mol; úsalos para comprobar el resultado.
- Bases ambiguas. N, R, Y y otros códigos no tienen una masa definida, por eso la calculadora pide bases simples.
- Plásmidos. Un plásmido circular no tiene extremos; la diferencia con el valor lineal (unos 62 por cadena) es despreciable con miles de pares de bases.
Preguntas frecuentes
¿Cómo se calcula el peso molecular del ADN?
Sumando la masa de cada nucleótido tal como está en la cadena: A 313,21, T 304,2, C 289,18 y G 329,21 g/mol para el ADN, y restando 61,96 por los extremos de una cadena con 5′-OH. El ARN usa A 329,21, U 306,17, C 305,18 y G 345,21. Son los valores de la fórmula de Thermo Fisher y OligoCalc, muy extendida.
¿Qué significa el −61,96?
Cada masa de residuo incluye un fosfato. Un oligo sintético no tiene fosfato en el extremo 5′ y tiene un hidroxilo en el 3′, así que se quita un HPO₃ (79,98) y se añade un agua (18,02): −61,96. Si eliges 5′ fosfato, se vuelven a sumar los 79,98.
¿Cómo se trata el ADN bicatenario?
La cadena complementaria se construye a partir de tu secuencia (A con T, G con C) y se suman las dos cadenas, cada una con sus extremos. Las filas muestran la masa de cada cadena.
¿Cómo paso de microgramos a picomoles?
pmol = µg × 10⁶ ÷ peso molecular. La calculadora muestra cuántos picomoles hay en 1 µg; multiplícalo por tu cantidad en microgramos. Para la secuencia por defecto de 66 bases, 1 µg son 48,841 pmol.
¿Por qué el dato de mi proveedor puede diferir un poco?
Los proveedores pueden usar masas de residuo algo distintas, contar sales de sodio o incluir modificaciones (fluoróforos, fosforotioatos). Diferencias de unos daltons en decenas de miles son normales.